Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TAF1DQ9H5J8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TAF1DQ9H5J8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TAF1DQ9H5J8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms