Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG10Q9H0Y0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG10Q9H0Y0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms