Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NYXQ9GZU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NYXQ9GZU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms