Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BRIP1Q9BX63 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRIP1Q9BX63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms