Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMIM7Q9BQ49 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM7Q9BQ49 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms