Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSF3RQ99062 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSF3RQ99062 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms