Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC4A9Q96Q91 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A9Q96Q91 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC4A9Q96Q91 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms