Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00052Q96N35 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00052Q96N35 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms