Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF354BQ96LW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF354BQ96LW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms