Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNPC3Q96LT9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNPC3Q96LT9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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