Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MAGED4Q96JG8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGED4Q96JG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms