Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK5RAP3Q96JB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms