Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM17Q96I25 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM17Q96I25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms