Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NXPE2Q96DL1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXPE2Q96DL1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms