Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF4BQ92750 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF4BQ92750 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms