Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD6Q92537 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD6Q92537 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms