Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PALLDQ8WX93 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PALLDQ8WX93 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PALLDQ8WX93 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms