Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KNL1Q8NG31 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KNL1Q8NG31 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms