Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL3Q8ND23 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms