Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARRDC4Q8NCT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARRDC4Q8NCT1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARRDC4Q8NCT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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