Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N8P6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8N8P6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8N8P6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8N8P6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms