Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00269Q8N2A0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms