Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LGI3Q8N145 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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