Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DZIP3Q86Y13 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms