Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms