Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAXIP1Q6ZW49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAXIP1Q6ZW49 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms