Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LINC00299Q6ZSB3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00299Q6ZSB3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms