Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPOCD1Q6ZMY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPOCD1Q6ZMY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms