Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ZNF598-209ENST00000567625 775 ntTSL 514.61□□□□□ -0.076e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 314.5□□□□□ -0.096e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.95□□□□□ -0.186e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.26e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.246e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.256e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 313.47□□□□□ -0.256e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.266e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 213.4□□□□□ -0.266e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.476e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF212-203ENST00000481584 581 ntTSL 312.06□□□□□ -0.486e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.56e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 211.78□□□□□ -0.526e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.556e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.556e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.556e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.576e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 211.23□□□□□ -0.616e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 CCDC12-211ENST00000604367 2412 nt11.12□□□□□ -0.636e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.656e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.666e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 POLD2-210ENST00000463464 707 ntTSL 210.53□□□□□ -0.726e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 510.3□□□□□ -0.766e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.776e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.96e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 29.32□□□□□ -0.926e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF212-205ENST00000488917 559 ntTSL 49.25□□□□□ -0.936e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 LINC01667-203ENST00000623933 668 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.986e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.996e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -16e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-215ENST00000526601 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.026e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 AC012653.1-201ENST00000558410 931 ntBASIC8.16□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC8.15□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.116e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.126e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.126e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.136e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.176e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-207ENST00000429541 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.186e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.186e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.26e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-204ENST00000354599 2970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.216e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 27.32□□□□□ -1.246e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-205ENST00000399602 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.266e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.296e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.296e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 26.83□□□□□ -1.326e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.326e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 CHCHD3-206ENST00000496427 721 ntTSL 56.53□□□□□ -1.366e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.386e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.386e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.396e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 36.29□□□□□ -1.46e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.416e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.566e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-202ENST00000442635 300 ntTSL 54.87□□□□□ -1.636e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.636e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.676e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.736e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PLCL1-205ENST00000487695 3083 ntTSL 53.37□□□□□ -1.876e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.986e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -26e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 IPO5-209ENST00000470493 548 ntTSL 22.49□□□□□ -2.016e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.26e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.216e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-206ENST00000534948 8270 ntTSL 1 (best)0.71□□□□□ -2.36e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.336e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 RSF1-212ENST00000534794 487 ntTSL 30.46□□□□□ -2.346e-6■■■□□ 17.7
NIPBLQ6KC79 KNL1-212ENST00000534204 565 ntTSL 412.08□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.822e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 KNL1-211ENST00000533001 5923 ntTSL 1 (best)2.66□□□□□ -1.982e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.992e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -22e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 510.25□□□□□ -0.773e-15■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 37.64□□□□□ -1.193e-15■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 57.48□□□□□ -1.213e-15■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.61□□□□□ -1.993e-15■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.818e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.662e-12■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-12■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.22e-12■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.452e-12■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.452e-12■■■□□ 17.6
NIPBLQ6KC79 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 17.5
NIPBLQ6KC79 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.087e-7■■■□□ 17.5
NIPBLQ6KC79 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.17e-7■■■□□ 17.5
NIPBLQ6KC79 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 512.54□□□□□ -0.47e-7■■■□□ 17.5
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 48.5 ms