Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT79Q5XKE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT79Q5XKE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms