Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CARMIL1Q5VZK9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CARMIL1Q5VZK9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CARMIL1Q5VZK9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms