Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
CHIC1Q5VXU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CHIC1Q5VXU3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms