Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM164Q5U3C3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms