Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGAP29Q52LW3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms