Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRADDQ15628 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRADDQ15628 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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