Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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