Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 KLK1-204ENST00000596300 912 ntTSL 216.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 KLK1-202ENST00000593325 1854 ntTSL 215.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 32.5
PABPC4Q13310 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.551e-323■■■■■ 32.4
PABPC4Q13310 RPS24-210ENST00000478655 727 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.461e-323■■■■■ 32.4
PABPC4Q13310 RPL39-202ENST00000468844 1915 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 32.4
PABPC4Q13310 MCRIP1-209ENST00000575090 752 ntTSL 327.23■■□□□ 1.951e-8■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-12■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.751e-12■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.051e-12■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-12■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-43■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.284e-43■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 535.94■■■■□ 3.342e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-212ENST00000568689 1998 ntTSL 333.08■■■□□ 2.892e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-209ENST00000567120 2205 ntTSL 1 (best)31.15■■■□□ 2.582e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.482e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.232e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.162e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.052e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.042e-20■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAC3D1-204ENST00000530213 1563 ntTSL 1 (best)27.24■■□□□ 1.952e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.912e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-206ENST00000469895 681 ntTSL 326.77■■□□□ 1.882e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-218ENST00000468546 1438 ntTSL 226.51■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 C15orf61-204ENST00000560547 461 ntTSL 226.5■■□□□ 1.832e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-206ENST00000602479 752 ntTSL 326.43■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-207ENST00000602499 744 ntTSL 225.88■■□□□ 1.732e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAC3D1-202ENST00000528109 1518 ntTSL 1 (best)25.67■■□□□ 1.72e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.662e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 325.02■■□□□ 1.62e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.492e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAC3D1-203ENST00000529996 1366 ntTSL 224.23■■□□□ 1.472e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-210ENST00000531581 1526 ntTSL 523.25■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NSMCE4A-211ENST00000489266 2399 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-203ENST00000404869 505 ntTSL 522.56■■□□□ 1.22e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 222.12■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-202ENST00000372220 1741 ntTSL 521.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GAS6-204ENST00000608763 2646 nt20.98■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-220ENST00000479915 1752 ntTSL 220.33■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-207ENST00000480197 554 ntTSL 418.72■□□□□ 0.592e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GAS6-203ENST00000480426 2507 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GORASP1-212ENST00000452389 2933 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-20■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-20■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NUBP1-203ENST00000571175 674 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GORASP1-211ENST00000441302 3240 ntTSL 216.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 FUOM-206ENST00000478895 445 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 SAAL1-213ENST00000532452 451 ntTSL 316.28■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 DTX2-216ENST00000465488 776 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 HRAS-209ENST00000479482 485 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-208ENST00000490432 620 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 GORASP1-213ENST00000453680 2873 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NUBP1-208ENST00000574691 517 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 JMJD8-211ENST00000568313 955 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 POMT1-215ENST00000485278 3420 ntTSL 212.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 C6orf203-204ENST00000625458 1146 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NUBP1-205ENST00000573663 472 ntTSL 312.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 TAF1B-202ENST00000402170 715 ntTSL 511.84□□□□□ -0.512e-11■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 UBE2E3-203ENST00000602291 766 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 32.3
PABPC4Q13310 NET1-202ENST00000380359 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 32.3
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