Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RLFQ13129 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLFQ13129 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RLFQ13129 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RLFQ13129 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RLFQ13129 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RLFQ13129 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RLFQ13129 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RLFQ13129 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RLFQ13129 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RLFQ13129 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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