Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	IPI1	YHR085W	1005 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP2	tY(GUA)D	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP11	tY(GUA)F1	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP6	tY(GUA)F2	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP7	tY(GUA)J1	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP4	tY(GUA)J2	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP5	tY(GUA)M1	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP8	tY(GUA)M2	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUP3	tY(GUA)O	75 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YJL193W	YJL193W	1209 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	PER33	YLR064W	822 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SMD2	YLR275W	333 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	NBP1	YLR457C	960 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	EAF7	YNL136W	1278 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YOL118C	YOL118C	309 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YBR013C	YBR013C	390 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YOR152C	YOR152C	771 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SCO1	YBR037C	888 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RPN7	YPR108W	1290 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	MNN2	YBR015C	1794 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	QRI1	YDL103C	1434 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	HTB1	YDR224C	396 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SEC20	YDR498C	1152 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	CAB1	YDR531W	1104 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	CAF16	YFL028C	870 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YIP5	YGL161C	933 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SUB1	YMR039C	879 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	PRE7	YBL041W	726 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	INP1	YMR204C	1263 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	GLO4	YOR040W	858 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	BUD21	YOR078W	645 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RBD2	YPL246C	789 nt		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RGT1	YKL038W	3513 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	MSS2	YDL107W	1056 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	DBF4	YDR052C	2115 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	PLP1	YDR183W	693 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	DDI2	YFL061W	678 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	DSD1	YGL196W	1287 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	CCE1	YKL011C	1062 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YJU3	YKL094W	942 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	POM33	YLL023C	840 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	DDI3	YNL335W	678 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YBR016W	YBR016W	387 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SFB3	YHR098C	2790 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	ALD6	YPL061W	1503 nt		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	FET3	YMR058W	1911 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RAD3	YER171W	2337 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	IRC22	YEL001C	678 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YGR015C	YGR015C	987 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	BTN2	YGR142W	1233 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RPC17	YJL011C	486 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	POP8	YBL018C	402 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	PGA3	YML125C	939 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SRT1	YMR101C	1032 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	HUA2	YOR284W	732 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RXT2	YBR095C	1293 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	MRC1	YCL061C	3291 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	PHO8	YDR481C	1701 nt		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	MID1	YNL291C	1647 nt		4.9	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	AIM10	YER087W	1731 nt		4.9	□□□□□ -1.62
MSL5	Q12186	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	MRPL1	YDR116C	858 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	JAC1	YGL018C	555 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	ARO2	YGL148W	1131 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	YHR127W	YHR127W	732 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	YJL068C	YJL068C	900 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	CPR7	YJR032W	1182 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	MBR1	YKL093W	1020 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	YLL037W	YLL037W	381 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	SPC3	YLR066W	555 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	ATG33	YLR356W	594 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	RAD10	YML095C	633 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	SNO1	YMR095C	675 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	RPS15	YOL040C	429 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	TPT1	YOL102C	693 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	UMP1	YBR173C	447 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	STB3	YDR169C	1542 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	YPK2	YMR104C	2034 nt		4.9	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	DBP5	YOR046C	1449 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	SHE10	YGL228W	1734 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	MBP1	YDL056W	2502 nt		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	Q12186	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.89	□□□□□ -1.63

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