Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RIPPLY1Q0D2K3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms