Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DDR1Q08345 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDR1Q08345 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms