Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLEQ07864 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLEQ07864 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLEQ07864 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLEQ07864 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLEQ07864 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLEQ07864 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLEQ07864 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms