Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	RRP40	YOL142W	723 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SRB6	YBR253W	366 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YCL012C	YCL012C	405 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	PRM7	YDL039C	2097 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	PMT5	YDL093W	2232 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	MMS2	YGL087C	414 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YKL023W	YKL023W	834 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YLR036C	YLR036C	612 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SNF8	YPL002C	702 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	RRB1	YMR131C	1536 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	MPH2	YDL247W	1830 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YDL109C	YDL109C	1944 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	MBP1	YDL056W	2502 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	AIM7	YDR063W	450 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YER187W	YER187W	426 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	HPM1	YIL110W	1134 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	FMP46	YKR049C	402 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	PRM9	YAR031W	897 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	PHM7	YOL084W	2976 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YPL073C	YPL073C	486 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	ISA2	YPR067W	558 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SED4	YCR067C	3198 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	FKH1	YIL131C	1455 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SEO1	YAL067C	1782 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	THS1	YIL078W	2205 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	MSC2	YDR205W	2175 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	COQ4	YDR204W	1008 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YLR124W	YLR124W	345 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	snR10	snR10	245 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	RFT1	YBL020W	1725 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	THI22	YPR121W	1719 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	TFG1	YGR186W	2208 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	NKP2	YLR315W	462 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	NCE103	YNL036W	666 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	KEX1	YGL203C	2190 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	ABF1	YKL112W	2196 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	EKI1	YDR147W	1605 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	KIN2	YLR096W	3444 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	STE20	YHL007C	2820 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	TUP1	YCR084C	2142 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	TRM8	YDL201W	861 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	UBC1	YDR177W	648 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	TPS3	YMR261C	3165 nt		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	DAL81	YIR023W	2913 nt		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	GCR1	YPL075W	2358 nt		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	ARG4	YHR018C	1392 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PEX19	YDL065C	1029 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	CNL1	YDR357C	369 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	DSE3	YOR264W	1293 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PDX3	YBR035C	687 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	ESF1	YDR365C	1887 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	RAD28	YDR030C	1521 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	ADY3	YDL239C	2373 nt		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SAS10	YDL153C	1833 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	GPR1	YDL035C	2886 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	TMN2	YDR107C	2019 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	MRPL7	YDR237W	879 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PFA5	YDR459C	1125 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	BUD16	YEL029C	939 nt		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	TAF5	YBR198C	2397 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	RPC53	YDL150W	1269 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YKR075C	YKR075C	924 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SPO19	YPL130W	672 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	DEG1	YFL001W	1329 nt		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	HST1	YOL068C	1512 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	MST1	YKL194C	1389 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	LHP1	YDL051W	828 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	API2	YDR525W	330 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YLL017W	YLL017W	312 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	MRPL3	YMR024W	1173 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SKG3	YLR187W	3081 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PDR15	YDR406W	4590 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	ATH1	YPR026W	3636 nt		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	AKL1	YBR059C	3327 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	BUD25	YER014C-A	462 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YER085C	YER085C	522 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	MOB2	YFL034C-B	864 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	SNO1	YMR095C	675 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	ZRC1	YMR243C	1329 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	COP1	YDL145C	3606 nt		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	Q04048	YDL228C	YDL228C	642 nt		5.16	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.4 ms