Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPEQ02224 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms