Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA6Q01524 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms