Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRB1P82279 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRB1P82279 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRB1P82279 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRB1P82279 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRB1P82279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRB1P82279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRB1P82279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRB1P82279 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRB1P82279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRB1P82279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRB1P82279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRB1P82279 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRB1P82279 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRB1P82279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRB1P82279 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms