Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL23P62829 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL23P62829 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL23P62829 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL23P62829 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL23P62829 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL23P62829 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL23P62829 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms