Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSNL1P62760 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSNL1P62760 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms