Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDF10P55107 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDF10P55107 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDF10P55107 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF10P55107 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF10P55107 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF10P55107 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF10P55107 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDF10P55107 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF10P55107 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF10P55107 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF10P55107 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GDF10P55107 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDF10P55107 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDF10P55107 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDF10P55107 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF10P55107 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF10P55107 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF10P55107 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF10P55107 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF10P55107 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF10P55107 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GDF10P55107 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GDF10P55107 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF10P55107 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms