Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 AIR1YIL079C 1083 nt6.28□□□□□ -1.4
ATG2P53855 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt6.27□□□□□ -1.41
ATG2P53855 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6.27□□□□□ -1.41
ATG2P53855 YLR049CYLR049C 1287 nt6.27□□□□□ -1.41
ATG2P53855 YML131WYML131W 1098 nt6.27□□□□□ -1.41
ATG2P53855 YMR130WYMR130W 909 nt6.27□□□□□ -1.41
ATG2P53855 SKG6YHR149C 2205 nt6.26□□□□□ -1.41
ATG2P53855 YDR271CYDR271C 372 nt6.26□□□□□ -1.41
ATG2P53855 HSP104YLL026W 2727 nt6.26□□□□□ -1.41
ATG2P53855 BIK1YCL029C 1323 nt6.26□□□□□ -1.41
ATG2P53855 CLF1YLR117C 2064 nt6.25□□□□□ -1.41
ATG2P53855 NUP2YLR335W 2163 nt6.25□□□□□ -1.41
ATG2P53855 COX19YLL018C-A 297 nt6.24□□□□□ -1.41
ATG2P53855 BNA1YJR025C 534 nt6.23□□□□□ -1.41
ATG2P53855 GLT1YDL171C 6438 nt6.23□□□□□ -1.41
ATG2P53855 TSL1YML100W 3297 nt6.23□□□□□ -1.41
ATG2P53855 BOP2YLR267W 1713 nt6.22□□□□□ -1.41
ATG2P53855 CLA4YNL298W 2529 nt6.22□□□□□ -1.41
ATG2P53855 URA4YLR420W 1095 nt6.22□□□□□ -1.41
ATG2P53855 CHK1YBR274W 1584 nt6.21□□□□□ -1.41
ATG2P53855 MAD2YJL030W 591 nt6.21□□□□□ -1.42
ATG2P53855 SDO1YLR022C 753 nt6.21□□□□□ -1.42
ATG2P53855 LCB2YDR062W 1686 nt6.21□□□□□ -1.42
ATG2P53855 MAG1YER142C 891 nt6.2□□□□□ -1.42
ATG2P53855 MET3YJR010W 1536 nt6.2□□□□□ -1.42
ATG2P53855 OAR1YKL055C 837 nt6.19□□□□□ -1.42
ATG2P53855 NUP1YOR098C 3231 nt6.19□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 CAT5YOR125C 702 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 CDC4YFL009W 2340 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 ERG7YHR072W 2196 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 MDL1YLR188W 2088 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 UBP10YNL186W 2379 nt6.18□□□□□ -1.42
ATG2P53855 SKP2YNL311C 2292 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 SSM4YIL030C 3960 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 UBP7YIL156W 3216 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 YEL074WYEL074W 339 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 PPG1YNR032W 1107 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 YNR061CYNR061C 660 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 NOG1YPL093W 1944 nt6.17□□□□□ -1.42
ATG2P53855 CMK1YFR014C 1341 nt6.16□□□□□ -1.42
ATG2P53855 YDR056CYDR056C 618 nt6.15□□□□□ -1.42
ATG2P53855 GPP1YIL053W 753 nt6.15□□□□□ -1.42
ATG2P53855 PBN1YCL052C 1251 nt6.15□□□□□ -1.42
ATG2P53855 AAP1YHR047C 2571 nt6.15□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 IMP4YNL075W 873 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 HRK1YOR267C 2280 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 ALG9YNL219C 1668 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YPL041CYPL041C 624 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 OPY2YPR075C 1083 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 TIM12YBR091C 330 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 POF1YCL047C 777 nt6.14□□□□□ -1.43
ATG2P53855 TRM8YDL201W 861 nt6.13□□□□□ -1.43
ATG2P53855 AGE2YIL044C 897 nt6.13□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YIL077CYIL077C 963 nt6.13□□□□□ -1.43
ATG2P53855 SFK1YKL051W 1062 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 COQ5YML110C 924 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 NRK1YNL129W 723 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 CDC15YAR019C 2925 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 EHD3YDR036C 1503 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 RAD2YGR258C 3096 nt6.12□□□□□ -1.43
ATG2P53855 UPC2YDR213W 2742 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 LCB5YLR260W 2064 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PAU10YDR542W 363 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PAU11YGL261C 363 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PAU13YHL046C 363 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 MTD1YKR080W 963 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PAU4YLR461W 363 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PEX30YLR324W 1572 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YOR1YGR281W 4434 nt6.11□□□□□ -1.43
ATG2P53855 DAL81YIR023W 2913 nt6.1□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YPR022CYPR022C 3402 nt6.1□□□□□ -1.43
ATG2P53855 RSC4YKR008W 1878 nt6.1□□□□□ -1.43
ATG2P53855 TGL4YKR089C 2733 nt6.1□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt6.1□□□□□ -1.43
ATG2P53855 ALT2YDR111C 1524 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 PRD1YCL057W 2139 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 YDL121CYDL121C 450 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 SOL4YGR248W 768 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 RIB4YOL143C 510 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 ARC40YBR234C 1155 nt6.09□□□□□ -1.43
ATG2P53855 STE23YLR389C 3084 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG2P53855 OCA2YNL056W 594 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG2P53855 CTT1YGR088W 1689 nt6.08□□□□□ -1.44
ATG2P53855 CHL1YPL008W 2586 nt6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms